Expression datant du milieu du XIXe siècle. Elle a été utilisée par les prostituées parisiennes. C'est une métaphore, dont le plafond indique le haut de la boîte crânienne, où il y a l'araignée, qui vit généralement dans des endroit négligés et qui véhicule une image de délabrement. Donc si l'on évoque une araignée dans un crâne, c'est pour dire que cette personne n'a pas un comportement normal, est un peu dérangée.